Die Forschungsstation auf Jungfraujoch wird von der Internationalen Stiftung Hochalpine Forschungsstationen Jungfraujoch und Gornergrat (HFSJG) betrieben. Die Schweizerische Kommission für die Hochalpine Forschungsstation Jungfraujoch der SCNAT (kurz Jungfraujoch-Kommission) vertritt die Interessen der Schweizer Forschenden in der Stiftung und hat auch Einsitz in deren Stiftungsrat.
Am 14. Oktober 1922 wurde die Schweizer Naturforschende Gesellschaft vom Schweizer Bundesrat beauftragt, eine Forschungsstation auf dem Jungfraujoch zu planen und zu realisieren. Die Naturforschende Gesellschaft hat daraufhin die Jungfraujoch-Kommission gegründet, welche für die Ausführung des Auftrags verantwortlich war. Mit Erfolg, denn die Forschungsstation auf Jungfraujoch wurde 1931 eröffnet.